MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Nitrosospira multiformis ATCC 25196 plasmid 2

Total Repeats: 237

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007616	TTA	2	6	716	721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82703912
2	NC_007616	TGG	2	6	901	906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82703912
3	NC_007616	TTC	2	6	912	917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82703912
4	NC_007616	TC	3	6	1049	1054	0 %	50 %	0 %	50 %	82703912
5	NC_007616	CAA	2	6	1128	1133	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82703912
6	NC_007616	GCGA	2	8	1213	1220	25 %	0 %	50 %	25 %	82703912
7	NC_007616	TCA	2	6	1260	1265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82703912
8	NC_007616	AGG	2	6	1298	1303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82703912
9	NC_007616	AGAA	2	8	1389	1396	75 %	0 %	25 %	0 %	82703912
10	NC_007616	CAGAA	2	10	1518	1527	60 %	0 %	20 %	20 %	82703912
11	NC_007616	TCA	2	6	1577	1582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82703912
12	NC_007616	GAA	2	6	1674	1679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82703913
13	NC_007616	ATT	2	6	1774	1779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82703913
14	NC_007616	AGG	2	6	1818	1823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82703913
15	NC_007616	TCG	2	6	1842	1847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82703913
16	NC_007616	TGA	2	6	1881	1886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82703913
17	NC_007616	TACG	2	8	1915	1922	25 %	25 %	25 %	25 %	82703913
18	NC_007616	CGG	2	6	1936	1941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82703913
19	NC_007616	CAA	2	6	2067	2072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82703913
20	NC_007616	ATTT	2	8	2144	2151	25 %	75 %	0 %	0 %	82703913
21	NC_007616	CT	3	6	2226	2231	0 %	50 %	0 %	50 %	82703913
22	NC_007616	TTC	2	6	2285	2290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82703913
23	NC_007616	TCA	2	6	2308	2313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82703913
24	NC_007616	AGC	2	6	2502	2507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703913
25	NC_007616	A	7	7	2597	2603	100 %	0 %	0 %	0 %	82703914
26	NC_007616	CAT	2	6	2640	2645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82703914
27	NC_007616	T	6	6	2694	2699	0 %	100 %	0 %	0 %	82703914
28	NC_007616	T	6	6	2763	2768	0 %	100 %	0 %	0 %	82703914
29	NC_007616	GCCT	2	8	3506	3513	0 %	25 %	25 %	50 %	82703915
30	NC_007616	GTT	2	6	3554	3559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82703915
31	NC_007616	GCC	2	6	3568	3573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82703915
32	NC_007616	TGA	2	6	3607	3612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82703915
33	NC_007616	TCA	2	6	3633	3638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82703915
34	NC_007616	AGGC	2	8	3781	3788	25 %	0 %	50 %	25 %	82703915
35	NC_007616	AGC	2	6	3900	3905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703915
36	NC_007616	TTG	2	6	3970	3975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82703915
37	NC_007616	GCG	2	6	4004	4009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82703915
38	NC_007616	CA	3	6	4062	4067	50 %	0 %	0 %	50 %	82703915
39	NC_007616	GCT	2	6	4174	4179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82703915
40	NC_007616	ACG	2	6	4199	4204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703915
41	NC_007616	T	7	7	4297	4303	0 %	100 %	0 %	0 %	82703915
42	NC_007616	CAA	2	6	4347	4352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82703916
43	NC_007616	TCT	2	6	4353	4358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82703916
44	NC_007616	GC	3	6	4396	4401	0 %	0 %	50 %	50 %	82703916
45	NC_007616	TGT	2	6	4461	4466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82703916
46	NC_007616	ACC	2	6	4490	4495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82703916
47	NC_007616	AAT	2	6	4525	4530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82703916
48	NC_007616	CTT	2	6	4549	4554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82703916
49	NC_007616	AAC	2	6	5301	5306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82703917
50	NC_007616	CGA	2	6	5362	5367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703917
51	NC_007616	CAA	2	6	5369	5374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82703917
52	NC_007616	AAG	2	6	5450	5455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82703917
53	NC_007616	AAT	2	6	5543	5548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82703917
54	NC_007616	CT	4	8	5630	5637	0 %	50 %	0 %	50 %	82703917
55	NC_007616	GTCT	2	8	5838	5845	0 %	50 %	25 %	25 %	82703917
56	NC_007616	TTG	2	6	6008	6013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82703917
57	NC_007616	GAT	2	6	6038	6043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82703917
58	NC_007616	GGT	2	6	6061	6066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82703917
59	NC_007616	GTT	2	6	6096	6101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82703918
60	NC_007616	CAG	2	6	6135	6140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703918
61	NC_007616	GT	3	6	6215	6220	0 %	50 %	50 %	0 %	82703918
62	NC_007616	TCA	2	6	6242	6247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82703918
63	NC_007616	AGAC	2	8	6267	6274	50 %	0 %	25 %	25 %	82703918
64	NC_007616	CTG	2	6	6291	6296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82703918
65	NC_007616	TGGA	2	8	6369	6376	25 %	25 %	50 %	0 %	82703918
66	NC_007616	ACG	2	6	6397	6402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703918
67	NC_007616	CTC	2	6	6406	6411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82703918
68	NC_007616	ACG	2	6	6424	6429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703918
69	NC_007616	AAC	2	6	6430	6435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	82703918
70	NC_007616	TGAA	2	8	6716	6723	50 %	25 %	25 %	0 %	82703918
71	NC_007616	TG	3	6	6764	6769	0 %	50 %	50 %	0 %	82703918
72	NC_007616	ATC	2	6	6793	6798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82703918
73	NC_007616	TGCTT	2	10	6822	6831	0 %	60 %	20 %	20 %	82703918
74	NC_007616	CAT	2	6	6873	6878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82703918
75	NC_007616	CCT	2	6	6879	6884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	82703918
76	NC_007616	CTT	2	6	6896	6901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82703918
77	NC_007616	CTA	2	6	7002	7007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82703918
78	NC_007616	CCA	2	6	7013	7018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82703918
79	NC_007616	CGA	2	6	7044	7049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703918
80	NC_007616	ACC	2	6	7067	7072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	82703918
81	NC_007616	GAG	2	6	7106	7111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82703918
82	NC_007616	TGCG	2	8	7147	7154	0 %	25 %	50 %	25 %	82703918
83	NC_007616	TAA	2	6	7197	7202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	82703918
84	NC_007616	CTG	2	6	7335	7340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82703918
85	NC_007616	AAGG	2	8	7351	7358	50 %	0 %	50 %	0 %	82703918
86	NC_007616	AAG	2	6	7393	7398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82703918
87	NC_007616	GGA	2	6	7421	7426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82703918
88	NC_007616	GCG	2	6	7519	7524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82703918
89	NC_007616	ATTG	2	8	7796	7803	25 %	50 %	25 %	0 %	82703919
90	NC_007616	GCG	2	6	7871	7876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82703919
91	NC_007616	ATC	2	6	7902	7907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82703919
92	NC_007616	TTA	2	6	7929	7934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82703919
93	NC_007616	TGA	2	6	7965	7970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82703919
94	NC_007616	GCT	2	6	7996	8001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82703919
95	NC_007616	CGG	2	6	8035	8040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82703919
96	NC_007616	ATG	2	6	8061	8066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82703919
97	NC_007616	TA	3	6	8097	8102	50 %	50 %	0 %	0 %	82703920
98	NC_007616	TA	3	6	8105	8110	50 %	50 %	0 %	0 %	82703920
99	NC_007616	GCT	2	6	8128	8133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82703920
100	NC_007616	CCG	2	6	8137	8142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82703920
101	NC_007616	TGG	2	6	8174	8179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	82703920
102	NC_007616	ACG	2	6	8209	8214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703920
103	NC_007616	GGC	2	6	8283	8288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82703920
104	NC_007616	CTG	2	6	8441	8446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82703920
105	NC_007616	TACGT	2	10	8493	8502	20 %	40 %	20 %	20 %	82703920
106	NC_007616	TAC	2	6	8523	8528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	82703920
107	NC_007616	TC	3	6	8545	8550	0 %	50 %	0 %	50 %	82703920
108	NC_007616	GTT	3	9	8647	8655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82703920
109	NC_007616	GAT	2	6	8679	8684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	82703920
110	NC_007616	TGTC	2	8	9224	9231	0 %	50 %	25 %	25 %	82703921
111	NC_007616	TTG	2	6	9271	9276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82703921
112	NC_007616	AACCA	2	10	9378	9387	60 %	0 %	0 %	40 %	82703921
113	NC_007616	CGA	2	6	9458	9463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703921
114	NC_007616	A	6	6	9510	9515	100 %	0 %	0 %	0 %	82703921
115	NC_007616	GCG	2	6	9593	9598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82703921
116	NC_007616	GAG	2	6	9676	9681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	82703921
117	NC_007616	GTT	2	6	9718	9723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82703921
118	NC_007616	TGAG	2	8	9746	9753	25 %	25 %	50 %	0 %	82703921
119	NC_007616	ATT	2	6	9824	9829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82703921
120	NC_007616	CGG	2	6	9853	9858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82703921
121	NC_007616	A	7	7	9928	9934	100 %	0 %	0 %	0 %	82703921
122	NC_007616	CAG	2	6	9942	9947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703921
123	NC_007616	T	6	6	10040	10045	0 %	100 %	0 %	0 %	82703921
124	NC_007616	CGGG	2	8	10051	10058	0 %	0 %	75 %	25 %	82703921
125	NC_007616	TAT	2	6	10150	10155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82703921
126	NC_007616	ATT	2	6	10372	10377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	82703922
127	NC_007616	GTT	2	6	10408	10413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	82703922
128	NC_007616	CTT	2	6	10477	10482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82703922
129	NC_007616	CGG	2	6	10502	10507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	82703922
130	NC_007616	GCC	2	6	10520	10525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	82703922
131	NC_007616	TCT	2	6	10550	10555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82703922
132	NC_007616	CTG	2	6	10558	10563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	82703922
133	NC_007616	GCAA	2	8	10601	10608	50 %	0 %	25 %	25 %	82703922
134	NC_007616	GCTT	2	8	10616	10623	0 %	50 %	25 %	25 %	82703922
135	NC_007616	CTT	2	6	10771	10776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82703922
136	NC_007616	GAA	2	6	10777	10782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	82703922
137	NC_007616	CTT	2	6	10785	10790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	82703922
138	NC_007616	GCA	2	6	10820	10825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	82703922
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.